Το εκκλησιαστικό μουσείο της Ιεράς Mητροπόλεως Θεσσαλονίκης βρίσκεται στον ισόγειο χώρο του μητροπολιτικού μεγάρου, το οποίο βρίσκεται δίπλα στον Μητροπολιτικό ναό του αγίου Γρηγορίου του Παλαμά. Στο χώρο του Μουσείου αποτυπώνεται η θεολογική διάσταση της εικόνας στο χωροχρόνο μέσα από αξιόλογα εκθέματα, συνθέτοντας το μεγαλείο της Ορθόδοξης Παράδοσης. Προβάλλεται η δογματική σημασία της εικόνας για το σώμα της Εκκλησίας, ο τρόπος που αποτυπώνεται στις εικόνες το μυστήριο της Θείας Ενανθρωπήσεως αλλά και ο τρόπος με τον οποίο ενισχύεται για τους πιστούς η ελπίδα της σωτηρίας. Συγχρόνως παρουσιάζεται και η νεότερη ιστορία της Μητροπόλεως Θεσσαλονίκης.